Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC4Q03721 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNC4Q03721 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNC4Q03721 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNC4Q03721 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNC4Q03721 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms