Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ERCC6Q03468 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC43■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
ERCC6Q03468 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ERCC6Q03468 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
ERCC6Q03468 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms