Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Thbs2Q03350 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Thbs2Q03350 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs2Q03350 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms