Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnb1Q02248 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnb1Q02248 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnb1Q02248 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnb1Q02248 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms