Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN2Q02246 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN2Q02246 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNTN2Q02246 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms