Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ascl1Q02067 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl1Q02067 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms