Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp1Q01514 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp1Q01514 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms