Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAMQ00059 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAMQ00059 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms