Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD1P98174 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD1P98174 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD1P98174 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD1P98174 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD1P98174 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD1P98174 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD1P98174 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD1P98174 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD1P98174 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD1P98174 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD1P98174 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD1P98174 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD1P98174 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD1P98174 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD1P98174 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD1P98174 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD1P98174 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD1P98174 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD1P98174 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD1P98174 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD1P98174 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD1P98174 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD1P98174 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD1P98174 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD1P98174 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD1P98174 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD1P98174 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD1P98174 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD1P98174 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD1P98174 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD1P98174 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD1P98174 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD1P98174 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD1P98174 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD1P98174 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD1P98174 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD1P98174 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGD1P98174 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FGD1P98174 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGD1P98174 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGD1P98174 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms