Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apba2P98084 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apba2P98084 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apba2P98084 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apba2P98084 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apba2P98084 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apba2P98084 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apba2P98084 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apba2P98084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Apba2P98084 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apba2P98084 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apba2P98084 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms