Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tarbp2P97473 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp2P97473 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp2P97473 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.6 ms