Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIM1P81133 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIM1P81133 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIM1P81133 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIM1P81133 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIM1P81133 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIM1P81133 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIM1P81133 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIM1P81133 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIM1P81133 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIM1P81133 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIM1P81133 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIM1P81133 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIM1P81133 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIM1P81133 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIM1P81133 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIM1P81133 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIM1P81133 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIM1P81133 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIM1P81133 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIM1P81133 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIM1P81133 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIM1P81133 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIM1P81133 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIM1P81133 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIM1P81133 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIM1P81133 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIM1P81133 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIM1P81133 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIM1P81133 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIM1P81133 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIM1P81133 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIM1P81133 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIM1P81133 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIM1P81133 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIM1P81133 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIM1P81133 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIM1P81133 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIM1P81133 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIM1P81133 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIM1P81133 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIM1P81133 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIM1P81133 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIM1P81133 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIM1P81133 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIM1P81133 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIM1P81133 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIM1P81133 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIM1P81133 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIM1P81133 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIM1P81133 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIM1P81133 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIM1P81133 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIM1P81133 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIM1P81133 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms