Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNTNAP1P78357 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNTNAP1P78357 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNTNAP1P78357 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP1P78357 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms