Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tbx6P70327 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tbx6P70327 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tbx6P70327 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms