Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms