Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM4P67936 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM4P67936 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM4P67936 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM4P67936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM4P67936 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM4P67936 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM4P67936 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM4P67936 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM4P67936 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM4P67936 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM4P67936 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM4P67936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM4P67936 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM4P67936 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM4P67936 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TPM4P67936 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM4P67936 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM4P67936 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM4P67936 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM4P67936 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM4P67936 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM4P67936 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM4P67936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM4P67936 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM4P67936 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM4P67936 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM4P67936 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM4P67936 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM4P67936 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPM4P67936 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM4P67936 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM4P67936 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM4P67936 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM4P67936 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM4P67936 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM4P67936 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM4P67936 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM4P67936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM4P67936 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM4P67936 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM4P67936 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM4P67936 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM4P67936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM4P67936 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM4P67936 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM4P67936 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM4P67936 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM4P67936 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM4P67936 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM4P67936 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPM4P67936 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPM4P67936 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPM4P67936 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPM4P67936 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms