Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2IP63279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2IP63279 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2IP63279 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms