Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ybx1P62960 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx1P62960 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx1P62960 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms