Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbx1P62878 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbx1P62878 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms