Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2P62838 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d2P62838 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2P62838 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms