Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6P62753 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6P62753 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6P62753 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6P62753 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6P62753 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6P62753 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6P62753 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6P62753 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6P62753 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6P62753 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6P62753 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6P62753 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6P62753 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6P62753 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6P62753 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6P62753 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6P62753 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6P62753 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6P62753 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6P62753 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6P62753 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6P62753 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6P62753 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6P62753 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6P62753 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6P62753 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6P62753 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6P62753 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6P62753 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6P62753 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6P62753 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6P62753 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6P62753 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6P62753 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6P62753 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6P62753 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6P62753 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6P62753 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6P62753 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6P62753 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6P62753 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6P62753 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6P62753 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6P62753 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6P62753 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6P62753 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6P62753 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6P62753 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6P62753 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6P62753 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms