Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copz1P61924 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copz1P61924 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Copz1P61924 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz1P61924 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz1P61924 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz1P61924 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz1P61924 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz1P61924 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz1P61924 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms