Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPZ1P61923 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPZ1P61923 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPZ1P61923 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms