Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NP61088 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NP61088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NP61088 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NP61088 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NP61088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NP61088 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NP61088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NP61088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2NP61088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NP61088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2NP61088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2NP61088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2NP61088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms