Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d1P61080 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d1P61080 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms