Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PlnP61014 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PlnP61014 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PlnP61014 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PlnP61014 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PlnP61014 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PlnP61014 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PlnP61014 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PlnP61014 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PlnP61014 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PlnP61014 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PlnP61014 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PlnP61014 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PlnP61014 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PlnP61014 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PlnP61014 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PlnP61014 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PlnP61014 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PlnP61014 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PlnP61014 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PlnP61014 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PlnP61014 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PlnP61014 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PlnP61014 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PlnP61014 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PlnP61014 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PlnP61014 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PlnP61014 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PlnP61014 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PlnP61014 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PlnP61014 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PlnP61014 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PlnP61014 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PlnP61014 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PlnP61014 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PlnP61014 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PlnP61014 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PlnP61014 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PlnP61014 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PlnP61014 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PlnP61014 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PlnP61014 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PlnP61014 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PlnP61014 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PlnP61014 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PlnP61014 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms