Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP54P61011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP54P61011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP54P61011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP54P61011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP54P61011 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP54P61011 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP54P61011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP54P61011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP54P61011 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP54P61011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP54P61011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP54P61011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP54P61011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP54P61011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP54P61011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP54P61011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP54P61011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP54P61011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP54P61011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP54P61011 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP54P61011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP54P61011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP54P61011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP54P61011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP54P61011 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP54P61011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP54P61011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP54P61011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP54P61011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP54P61011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP54P61011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP54P61011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRP54P61011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP54P61011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP54P61011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP54P61011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRP54P61011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP54P61011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP54P61011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP54P61011 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP54P61011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP54P61011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP54P61011 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP54P61011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP54P61011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP54P61011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP54P61011 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP54P61011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP54P61011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP54P61011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRP54P61011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRP54P61011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms