Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcif1P59114 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcif1P59114 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcif1P59114 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcif1P59114 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms