Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Csrnp1P59054 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Csrnp1P59054 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Csrnp1P59054 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms