Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP6P59044 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP6P59044 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP6P59044 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP6P59044 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP6P59044 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms