Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paxbp1P58501 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Paxbp1P58501 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms