Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCBP4P57723 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCBP4P57723 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms