Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCBP3P57721 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCBP3P57721 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCBP3P57721 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms