Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2BFSP57053 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2BFSP57053 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms