Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace1P56818 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bace1P56818 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Bace1P56818 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bace1P56818 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace1P56818 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace1P56818 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace1P56818 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bace1P56818 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bace1P56818 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bace1P56818 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.1 ms