Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1P56716 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1P56716 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1P56716 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1P56716 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1P56716 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1P56716 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1P56716 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms