Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp5P56399 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp5P56399 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp5P56399 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp5P56399 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp5P56399 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp5P56399 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp5P56399 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp5P56399 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp5P56399 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp5P56399 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp5P56399 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp5P56399 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp5P56399 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms