Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp1P56183 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp1P56183 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp1P56183 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms