Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GDF10P55107 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF10P55107 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF10P55107 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF10P55107 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF10P55107 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF10P55107 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF10P55107 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF10P55107 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF10P55107 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF10P55107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF10P55107 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF10P55107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF10P55107 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF10P55107 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF10P55107 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF10P55107 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF10P55107 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms