Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aqp4P55088 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aqp4P55088 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aqp4P55088 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aqp4P55088 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aqp4P55088 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aqp4P55088 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aqp4P55088 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aqp4P55088 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Aqp4P55088 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aqp4P55088 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aqp4P55088 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aqp4P55088 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aqp4P55088 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aqp4P55088 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Aqp4P55088 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aqp4P55088 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aqp4P55088 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Aqp4P55088 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Aqp4P55088 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms