Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSE1LP55060 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSE1LP55060 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSE1LP55060 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSE1LP55060 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms