Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC16A1P53985 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC16A1P53985 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC16A1P53985 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms