Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fdft1P53798 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fdft1P53798 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms