Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUCLG1P53597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUCLG1P53597 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUCLG1P53597 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms