Protein–RNA interactions for Protein: P53094

MDS3, Negative regulator of sporulation MDS3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3P53094 YPR202WYPR202W 717 nt10.25□□□□□ -0.77
MDS3P53094 MET30YIL046W 1923 nt10.25□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 SUF16tG(GCC)C 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 SUF20tG(GCC)F1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 SUF23tG(GCC)J2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 SUF17tG(GCC)O2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 PUF3YLL013C 2640 nt10.24□□□□□ -0.77
MDS3P53094 GNA1YFL017C 480 nt10.23□□□□□ -0.77
MDS3P53094 YOR041CYOR041C 432 nt10.23□□□□□ -0.77
MDS3P53094 RPS3YNL178W 723 nt10.23□□□□□ -0.77
MDS3P53094 TDP1YBR223C 1635 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 DUR3YHL016C 2208 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 YDL129WYDL129W 876 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 OPI11YPR044C 354 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 HSM3YBR272C 1443 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 CDC23YHR166C 1881 nt10.22□□□□□ -0.77
MDS3P53094 PAC2YER007W 1557 nt10.21□□□□□ -0.78
MDS3P53094 COX20YDR231C 618 nt10.21□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt10.21□□□□□ -0.78
MDS3P53094 HCR1YLR192C 798 nt10.21□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YNR042WYNR042W 429 nt10.21□□□□□ -0.78
MDS3P53094 MRK1YDL079C 1506 nt10.2□□□□□ -0.78
MDS3P53094 TPO3YPR156C 1869 nt10.2□□□□□ -0.78
MDS3P53094 ILV1YER086W 1731 nt10.2□□□□□ -0.78
MDS3P53094 DCN1YLR128W 810 nt10.2□□□□□ -0.78
MDS3P53094 CAR1YPL111W 1002 nt10.2□□□□□ -0.78
MDS3P53094 CBP4YGR174C 513 nt10.19□□□□□ -0.78
MDS3P53094 MRPS5YBR251W 924 nt10.19□□□□□ -0.78
MDS3P53094 HEL2YDR266C 1920 nt10.19□□□□□ -0.78
MDS3P53094 QCR6YFR033C 444 nt10.18□□□□□ -0.78
MDS3P53094 ATG12YBR217W 561 nt10.18□□□□□ -0.78
MDS3P53094 AAD15YOL165C 432 nt10.17□□□□□ -0.78
MDS3P53094 IME2YJL106W 1938 nt10.17□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YMR155WYMR155W 1644 nt10.17□□□□□ -0.78
MDS3P53094 CEM1YER061C 1329 nt10.17□□□□□ -0.78
MDS3P53094 MHP1YJL042W 4197 nt10.16□□□□□ -0.78
MDS3P53094 RIX7YLL034C 2514 nt10.16□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt10.16□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YLR194CYLR194C 765 nt10.16□□□□□ -0.78
MDS3P53094 LST8YNL006W 912 nt10.15□□□□□ -0.78
MDS3P53094 LDB16YCL005W 771 nt10.15□□□□□ -0.78
MDS3P53094 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt10.13□□□□□ -0.79
MDS3P53094 EDE1YBL047C 4146 nt10.13□□□□□ -0.79
MDS3P53094 YJR015WYJR015W 1533 nt10.13□□□□□ -0.79
MDS3P53094 IRC11YOR013W 471 nt10.12□□□□□ -0.79
MDS3P53094 YHC3YJL059W 1227 nt10.11□□□□□ -0.79
MDS3P53094 ECM31YBR176W 939 nt10.11□□□□□ -0.79
MDS3P53094 VID30YGL227W 2877 nt10.11□□□□□ -0.79
MDS3P53094 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt10.1□□□□□ -0.79
MDS3P53094 MLC1YGL106W 450 nt10.1□□□□□ -0.79
MDS3P53094 DFR1YOR236W 636 nt10.1□□□□□ -0.79
MDS3P53094 PYK2YOR347C 1521 nt10.1□□□□□ -0.79
MDS3P53094 MAE1YKL029C 2010 nt10.1□□□□□ -0.79
MDS3P53094 YRF1-2YER190W 5046 nt10.09□□□□□ -0.79
MDS3P53094 HXT9YJL219W 1704 nt10.09□□□□□ -0.79
MDS3P53094 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt10.09□□□□□ -0.79
MDS3P53094 MRPL13YKR006C 795 nt10.09□□□□□ -0.79
MDS3P53094 MRPL28YDR462W 444 nt10.08□□□□□ -0.8
MDS3P53094 PMT7YDR307W 1989 nt10.07□□□□□ -0.8
MDS3P53094 PRI2YKL045W 1587 nt10.07□□□□□ -0.8
MDS3P53094 HEM1YDR232W 1647 nt10.06□□□□□ -0.8
MDS3P53094 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt10.06□□□□□ -0.8
MDS3P53094 AFG1YEL052W 1530 nt10.06□□□□□ -0.8
MDS3P53094 GEF1YJR040W 2340 nt10.06□□□□□ -0.8
MDS3P53094 MDH3YDL078C 1032 nt10.05□□□□□ -0.8
MDS3P53094 CCC2YDR270W 3015 nt10.05□□□□□ -0.8
MDS3P53094 GCN3YKR026C 918 nt10.04□□□□□ -0.8
MDS3P53094 YCL041CYCL041C 495 nt10.04□□□□□ -0.8
MDS3P53094 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt10.03□□□□□ -0.8
MDS3P53094 YKL031WYKL031W 414 nt10.02□□□□□ -0.81
MDS3P53094 MEH1YKR007W 555 nt10.01□□□□□ -0.81
MDS3P53094 GAA1YLR088W 1845 nt10.01□□□□□ -0.81
MDS3P53094 ADE17YMR120C 1779 nt10□□□□□ -0.81
MDS3P53094 ERS1YCR075C 783 nt10□□□□□ -0.81
MDS3P53094 RRS1YOR294W 612 nt10□□□□□ -0.81
MDS3P53094 MAL31YBR298C 1845 nt10□□□□□ -0.81
MDS3P53094 FLC2YAL053W 2352 nt10□□□□□ -0.81
MDS3P53094 CNE1YAL058W 1509 nt9.99□□□□□ -0.81
MDS3P53094 PHB1YGR132C 864 nt9.99□□□□□ -0.81
MDS3P53094 YNL120CYNL120C 486 nt9.99□□□□□ -0.81
MDS3P53094 SNT309YPR101W 528 nt9.99□□□□□ -0.81
MDS3P53094 HRQ1YDR291W 3234 nt9.99□□□□□ -0.81
MDS3P53094 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt9.98□□□□□ -0.81
MDS3P53094 CDC34YDR054C 888 nt9.98□□□□□ -0.81
MDS3P53094 CCP1YKR066C 1086 nt9.98□□□□□ -0.81
MDS3P53094 HSV2YGR223C 1347 nt9.98□□□□□ -0.81
MDS3P53094 YMR010WYMR010W 1218 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.6 ms