Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd1P52734 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd1P52734 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fgd1P52734 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms