Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upp1P52624 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upp1P52624 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upp1P52624 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upp1P52624 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upp1P52624 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upp1P52624 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upp1P52624 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upp1P52624 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upp1P52624 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms