Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkmP52480 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkmP52480 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PkmP52480 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkmP52480 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkmP52480 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PkmP52480 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PkmP52480 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PkmP52480 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PkmP52480 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkmP52480 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PkmP52480 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PkmP52480 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkmP52480 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkmP52480 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PkmP52480 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PkmP52480 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PkmP52480 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PkmP52480 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PkmP52480 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PkmP52480 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PkmP52480 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PkmP52480 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkmP52480 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkmP52480 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkmP52480 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkmP52480 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkmP52480 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkmP52480 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkmP52480 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkmP52480 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkmP52480 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkmP52480 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkmP52480 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkmP52480 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkmP52480 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PkmP52480 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PkmP52480 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PkmP52480 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PkmP52480 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkmP52480 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PkmP52480 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkmP52480 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkmP52480 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkmP52480 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkmP52480 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkmP52480 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkmP52480 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkmP52480 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PkmP52480 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkmP52480 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkmP52480 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms