Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK4P51957 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK4P51957 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK4P51957 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK4P51957 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEK4P51957 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK4P51957 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK4P51957 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK4P51957 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEK4P51957 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEK4P51957 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NEK4P51957 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK4P51957 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK4P51957 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK4P51957 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK4P51957 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEK4P51957 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK4P51957 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEK4P51957 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK4P51957 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK4P51957 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK4P51957 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEK4P51957 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEK4P51957 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEK4P51957 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK4P51957 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEK4P51957 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEK4P51957 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK4P51957 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK4P51957 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK4P51957 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK4P51957 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEK4P51957 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK4P51957 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK4P51957 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK4P51957 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEK4P51957 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEK4P51957 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEK4P51957 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEK4P51957 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEK4P51957 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEK4P51957 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEK4P51957 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEK4P51957 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEK4P51957 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEK4P51957 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEK4P51957 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEK4P51957 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEK4P51957 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEK4P51957 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEK4P51957 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK4P51957 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK4P51957 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEK4P51957 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEK4P51957 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms