Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK3P51956 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEK3P51956 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK3P51956 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK3P51956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK3P51956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK3P51956 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEK3P51956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK3P51956 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK3P51956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK3P51956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEK3P51956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK3P51956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK3P51956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK3P51956 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK3P51956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK3P51956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK3P51956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK3P51956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK3P51956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK3P51956 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK3P51956 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK3P51956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK3P51956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK3P51956 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK3P51956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK3P51956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK3P51956 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK3P51956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK3P51956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK3P51956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK3P51956 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEK3P51956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK3P51956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEK3P51956 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEK3P51956 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEK3P51956 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK3P51956 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK3P51956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK3P51956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK3P51956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK3P51956 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK3P51956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK3P51956 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK3P51956 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK3P51956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK3P51956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK3P51956 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK3P51956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK3P51956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK3P51956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK3P51956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK3P51956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms